Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P10404 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P10404 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P10404 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P10404 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P10404 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms