Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Schip1P0DPB4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms