Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Becn2P0DM65 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms