Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1rP09581 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1rP09581 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms