Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NefmP08553 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NefmP08553 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NefmP08553 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NefmP08553 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NefmP08553 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NefmP08553 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NefmP08553 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NefmP08553 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms