Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa4P06798 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms