Protein–RNA interactions for Protein: P06684

C5, Complement C5, mousemouse

Predictions only

Length 1,680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5P06684 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5P06684 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C5P06684 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5P06684 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5P06684 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5P06684 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C5P06684 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5P06684 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5P06684 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5P06684 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5P06684 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5P06684 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms