Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgamP05555 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms