Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-K1P01901 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-K1P01901 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-K1P01901 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-K1P01901 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-K1P01901 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-K1P01901 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms