Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighg1P01869 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighg1P01869 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms