Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01735 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01735 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01735 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01735 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01735 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms