Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01664 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01664 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01664 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01664 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01664 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01664 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01664 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms