Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01645 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01645 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01645 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01645 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01645 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01645 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01645 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms