Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms