Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccl20O89093 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl20O89093 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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