Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MscO88940 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MscO88940 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MscO88940 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MscO88940 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MscO88940 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MscO88940 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MscO88940 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MscO88940 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MscO88940 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms