Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JtbO88824 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JtbO88824 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JtbO88824 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JtbO88824 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms