Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hcn2O88703 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms