Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp6O88572 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp6O88572 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms