Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnmt3bO88509 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms