Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms