Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns1O88456 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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