Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vti1bO88384 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms