Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms