Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd46O88174 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd46O88174 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms