Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Xirp1O70373 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms