Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itgb5O70309 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb5O70309 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms