Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrna4O70174 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms