Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Supt5hO55201 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms