Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms