Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms