Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1bO55017 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1bO55017 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms