Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SlkO54988 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SlkO54988 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SlkO54988 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SlkO54988 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SlkO54988 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SlkO54988 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SlkO54988 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms