Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LatO54957 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LatO54957 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LatO54957 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms