Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffbO54788 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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