Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EdaO54693 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EdaO54693 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms