Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cited2O35740 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cited2O35740 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms