Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf18O35714 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf18O35714 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms