Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NudcO35685 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NudcO35685 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NudcO35685 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NudcO35685 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NudcO35685 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NudcO35685 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NudcO35685 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NudcO35685 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NudcO35685 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NudcO35685 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NudcO35685 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NudcO35685 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NudcO35685 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NudcO35685 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms