Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clk4O35493 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms