Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk2O35491 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk2O35491 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk2O35491 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk2O35491 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms