Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms