Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d1bO35324 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d1bO35324 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms