Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms