Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RrhO35214 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RrhO35214 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RrhO35214 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RrhO35214 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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RrhO35214 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RrhO35214 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RrhO35214 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RrhO35214 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RrhO35214 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms