Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe40O35185 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms