Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ArxO35085 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ArxO35085 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ArxO35085 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ArxO35085 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ArxO35085 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ArxO35085 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ArxO35085 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ArxO35085 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ArxO35085 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ArxO35085 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ArxO35085 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms