Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn4O35054 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms