Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncoa3O09000 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncoa3O09000 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms