Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eftud2O08810 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms